对此，军方在最后通牒到期后宣布了让穆尔西下台的决定。塞西说：“最高宪法法院院长曼苏尔将宣誓代理总统一职。埃及将尽快举行总统选举，在此之前最高宪法法院院长将处理国家事务。”随后，军方还控制了穆兄会的一个电视台，半岛电视台埃及频道的负责人也因为播出穆尔西“被下台”后的讲话而被拘捕。
塞西指出，“军方不会对埃及人民的要求坐视不管，但将永远不涉足政治。”军方宣布决定时，埃及反对派的领导人，曾获得诺贝尔和平奖的前国际原子能机构总干事穆罕默德·巴拉迪在座。
在得知军方的决定后，穆尔西在半岛电视台发表讲话说，所有自由的人民都拒绝军方路线图，他呼吁所有埃及人不要响应军方的“政变”。穆尔西说：“政变将把埃及带入黑暗。”他说：“我已经准备好与任何方面展开对话。”他表示“不接受新的‘合法性’”。穆尔西的支持者此前也表示，军方的介入是“政变”。穆尔西的国家安全顾问发文称，“为了埃及，为了历史的准确性，让我们为现在正在发生的这一幕定义为：军事政变。”
对此，阿拉伯联盟前秘书长穆萨表示，“这不是政变。”军方的决定也让穆尔西的反对者欢呼雀跃，数万人走上开罗的解放广场，庆祝自己的胜利。有人表示，“这是新的历史性的一刻，我们除掉了穆尔西和穆兄会。”还有人高呼：“塞西是英雄，穆尔西不再是我的总统了。”