对于自己反对的内容，奥巴马称法案限制军方自主处理多余军舰和战机，致使五角大楼出现“不必要开支”，同时新军规要求“随军牧师不得作出有违其宗教信仰的举动”，奥巴马批评此举与政府保护同性恋军人的政策相左。

3日奥巴马签字后，美国2013财年《国防授权法案》正式生效。根据法案，该财年(2012年10月至2013年9月)美国军费预算总计约6330亿美元，其中5280亿美元用于采购武器、更新装备、支付工资等日常支出，880亿美元用于阿富汗战争，另外170亿美元用于核武项目。

法案包括涉钓鱼岛条款和涉台条款，但仅为表明国会意向，并无法律约束力。涉钓鱼岛条款声称美国对钓鱼岛主权归属不持立场，但承认日本对钓鱼岛的“行政管辖权”，并重申美国对日本安全的承诺；涉台条款呼吁美国向台湾地区出售F-16C/D或类似机型的战斗机。

在此之前，中国外交部发言人表示：《美日安保条约》是特定历史时期的双边安排，不应损害包括中国在内的第三方利益，更不应介入他国间领土争议。