据路透社报道，6月18日起，立陶宛开始禁止受欧盟制裁的货物通过立陶宛领土过境到加里宁格勒。被立陶宛限制后，商品仍能通过海运方式（但较麻烦）进口到加里宁格勒，该途径不受欧盟制裁。欧盟的对俄制裁清单上包括煤炭、金属、建筑材料和先进技术。禁令将会涉及到加里宁格勒进口的大约50%的货品。
面对俄方不断升级的警告，立陶宛方面选择硬刚，一边坚称他们只是在执行欧盟的对俄制裁措施，一边放话称不相信俄罗斯将“军事挑战”。
在双方剑拔弩张之际，欧盟外交与安全政策高级代表博雷利6月23日回应称，欧盟“无意阻止”俄罗斯和加里宁格勒飞地之间的交通。他补充说，目前，欧盟正审查对俄制裁的指导方针，以避免对加里宁格勒的交通造成麻烦。
路透社6月29日援引消息称，立陶宛与俄罗斯围绕加里宁格勒州过境运输的争端有望在未来数天内得到解决。在德国的支持下，欧盟官员期望同立陶宛达成协议，以化解同俄罗斯的问题，因为欧盟很难在坚持严厉制裁的同时，避免升级与俄罗斯的冲突，甚至是军事上擦枪走火。