但随后阿富汗陷入动荡，不但经历政权更迭，还遭遇了恐怖主义冲击和阿富汗战争，而伊朗也经历了伊斯兰革命等事件，双方水资源方面的合作也由此中断。
【赫尔曼德河是伊朗和阿富汗共有的水源】
而这次阿富汗塔利班临时政府，重新开始在赫尔曼德河上游修建大坝，除了满足蓄水需求，也不排除阿塔有可能想借水源分配，跟伊朗换石油或者得到更多利益。但水权换资源这件事，阿富汗前政府就跟伊朗提过，伊朗没答应，所以阿塔这次的目标大概率很难达成。
至于伊朗方面，一直认为自己得到的水资源不足，想跟阿富汗重新签约，但双方没有达成共识。为了得到更多的水资源，伊朗还放话，称如果阿富汗不放水，伊朗将驱逐锡斯坦和俾路支省的阿富汗难民。所以赫尔曼德河的水权最终会如何分配，伊朗和阿塔可能还需要几轮博弈。
这主要是因为，在涉及水源争端的时候，上游国家的地理优势更强，但是下游占据一定的外交优势。从军事实力和治理能力来看，伊朗的军事实力在中东地区一直都是排得上号的，虽然伊朗内部存在分歧，但总的来说，莱希政府在决策方面还是具有一定的话语权。
【相较于阿塔，伊朗政府的综合治理能力更高】
反观阿塔这边，塔利班临时政府的合法性目前还没有得到国际社会的公认，而阿塔临时政府在外交和内政治理方面，还有比较大的提升空间。所以综合来看，双方在水权方面的博弈，正处于一个微妙的平衡状态，只不过这个平衡随时有被打破的可能。
这里最大的不稳定因素，就是美国可能给当地局势带来影响。我们都知道，此前美国在阿富汗建立傀儡政权，牵制伊朗。现在阿富汗塔利班政权还没有被承认，但有美国政客建议联邦政府首先承认塔利班政权，以此作为自己的地缘政治资本。如果阿塔因为美国表面上的示好承认，作出偏向于美国的决策，那么很有可能会走上前阿富汗政府的老路子，这可能给伊朗带来一定的风险。