古巴领导人卡斯特罗与赫鲁晓夫
当美国侦察机拍摄到位于古巴的弹道导弹发射场照片时，随之而来的是震惊与果断的行动。毛主席事后曾在《人民日报》上不点名地批评苏联的行动是“在战术上的犯冒险主义错误”，这一评价确有道理。孤悬在美国腹地的古巴既是一支红色尖刺，但也是处在苏联控制范围外的“飞地”。换句话说，尽管古巴导弹危机发生在古巴，但从势力影响范围来看，这是在美国的主场。既然有如此大的主动权，而古巴岛上的核导弹威胁又难以忽视，美国会大动干戈地调动飞机舰艇全面封锁古巴，甚至计划轰炸和入侵古巴也是可以料想的了。
美国调集了68个空军中队与8个航母编队，多达90艘军舰，沿佛罗里达至波多黎各一线构成了半弧形封锁线。天空中还有美国及其盟友的各式飞机在多个海域执行搜索任务。面对美国方面气势汹汹的反应，赫鲁晓夫显然没有任何准备，他原本是计划11月份部队部署完成后再公开，没想到提前一个月被美国人探知了。作为一场“战术上的冒险主义”，由于古巴离苏联太远赫鲁晓夫能采取的措施非常有限。军事力量没什么指望，因为苏军没有那个能力，也没有办法去打破美国对古巴的封锁。唯一能做的只有用古巴岛上已部署的军队作为底牌和美国在外交上讨价还价。
赫鲁晓夫也清楚，美国与苏联不一样，它在军事上有多种选择可以做。美国将军们不止一次在肯尼迪耳边要求“先发制人”，用空袭将苏联的弹道导弹摧毁在地面上。一支庞大的武装力量也聚集在佛罗里达州，准备随时入侵古巴。尤其是在U-2侦察机被苏联驻古巴防空导弹击落后，空军更是暴跳如雷，要求总统立刻采取行动，甚至威胁没有总统授权也会在10月29日发起空袭。因此在赫鲁晓夫通过驻美大使与肯尼迪弟弟会谈后，得知了肯尼迪的处境，美国可能于29日发起空袭，肯尼迪也私下做出了半年内撤出驻土耳其导弹的许诺。赫鲁晓夫立刻于28日发布讲话，宣布决定撤出驻古巴导弹，古巴导弹危机至此结束。