B-21轰炸机隐身性能得到强化之后，对我国各级防空系统提出了更大的挑战，对我国国土防空构成了严重威胁，我国可能需要针对B-21轰炸机的隐身特性而专门研发新一代反隐身作战系统。
其次，B-21轰炸机信息化程度以及电子战能力远优于B-2轰炸机，能够更加适应未来战争需求。据悉，B-21轰炸机采用了最新型开放式航电系统架构，突出于其他作战平台的互联互通能力，不但可以与无人机、预警机、卫星等组成联合火力体系, 而且还可以从其他平台获得目标数据和电子对抗支援。此外，B-21轰炸机海大幅强化了对地、对海侦测能力，具备完整的情报监视侦查能力，并且配备有先进的NGJ电子战设备，拥有强大的电子战能力。以上这些改进功能都大幅增加了我国探测、拦截B-21轰炸机的难度，威胁程度大增。
再次，B-21轰炸机具有更大的灵活性，可以携带各种攻击武器，让我国防不胜防。虽然B-21轰炸机在飞行参数上较B-2轰炸机进行了缩水，但是凭借着轻量化的机身以及较大的内置弹舱，依然对我国构成了严重威胁。由于B-21轰炸机体型较小，可以在一些简易的机场进行起降，这意味着美国西太平洋上所有能用的机场都可能是部署B-21轰炸机，而关岛以及澳大利亚北部仅是两个重要的部署地点，这极大的增大了我国弹道导弹以及巡航导弹提前摧毁B-21轰炸机的难度。
相较于B-2轰炸机，B-21轰炸机机腹有相当大的隆起，这意味着B-21轰炸机拥有较大的内置弹仓，可以携带多款大型攻击弹药。根据美国空军的说法，B-21轰炸机同样可以携带GBU-57/B 这样的大型钻地弹，这意味着B-21轰炸机具备了携带多枚远程巡航导弹甚至是高超音速导弹的能力，远程攻击能力甚至超越了B-2轰炸机。