这要根据自己的喜爱，单纯从工资待遇上讲，肯定是副高职称比副科级划算，必经工资高不少。但从另一角度讲，副科级经过三年后可以升级正科，再几年升副处、正处，那就比副高职称好多了。还有就是，公务员副科级就是县一级机构的副局长，如果是实职领导的话，接触的人与事要多得多，学习的东西很多。虽然工作没有事业单位单纯，但对个人成长有一定的好处。
总之，不管什么岗位，都要努力为人民服务，为党努力工作。
这要看你个人志向。愿意改行从政，得适应环境，准备吃苦，甘愿奉献，千万不要被时下认为的当干部有种种好处所蒙弊。按照你的年龄推算，当乡镇党委书记有点难了。就工资而言，副高职称已对应副处级了，你目前是40岁，退休前副高五级是有希望的，工资不比正处级少。
个人建议去，换个岗位换种经历总归是好事，很多东西并不是完全用经济价值可以衡量的。
40岁的村小校长拿到了副高，并且能够通过比选进入乡镇领导班子，说明题主的学习能力不错，有一定的素质，得到了领导的赏识，这是当下你转身份的关键所在，也是未来你走行政路线必须足够重视并且用足用好的资源。现实中教而优则仕的例子比比皆是，多数都发展不错，有的还走上了较高的领导岗位，如今你向前辈们看齐不失为好的选择。你应该建立信心，要杀伐决断，而不是犹豫不决，某种程度来说这直接影响你未来的仕途走势。这是过来人给你的忠告。
现下，有几点你必须有所准备：
第一，做好经济损失的心理准备 。乡镇副科级公务员与同级的事业编相比，工资待遇稍占优势。但对比相当于处级待遇的副高，肯定不在一个档次，尽管公务员有车补等补贴。保守估计，一年要损失一万五到两万左右，这还是中西部的水平。如果要走出学校，这是你必须付出的代价。
第二，要迅速转换工作思维 。在学校当校长，主责是抓教学，面对的对象相对单一，处理的问题也比较简单（尽管很多老师觉得学生不好管），对思维的作用、能力的输出不会太高，尤其是在村小，而且还是校长。乡镇机关不一样，面对的是全乡镇所有干部群众，工作涉及方方面面，作为领导还得承担很多专项任务，比如招商、项目建设等，每天需要处理的各种难题、各项事务比在学校工作要复杂得多，也难得多，显然不能再用过去的老思维去对待。
不要以为你去了乡镇当人大副主席就是管人大这一块工作，没有那么简单。乡镇作为一级政府，上面千条线，下面一根针，人少事多，根本没有条件允许某个人只干单一一种活。到了乡镇工作，大概率你会被书记、乡镇长和人大主席安排很多与你本职无关的工作，此时你不能抱怨，更不能拒绝或者说不会。你需要做三件事：1、紧跟领导步伐。三个主要领导交代的，第一时间去做，凡事做到有响应；2、学会早请示晚汇报。接受任务埋头去干，在干的过程中也要学会汇报，一方面是让领导掌握实情，增加印象，另一方面通过这种方式也可以加强沟通，更清楚了解领导意图的同时，吸收领导一些意见和建议，做到有的放矢；3、注意团结同志。多结善缘，广交朋友，不能做到友好相处，也不能让对方成为自己的敌人，在未来的道路上给自己制造绊脚石。这是能干事干成事的基本条件。
第三，不要太过急功近利 。事业编能够转公务员的不多，你的到来难免会引来猜忌，让一些人琢磨你的来路、背景，特别关注你的发展和进步。此时你若太过急躁，总想一锄头挖出个金娃娃，难免招来非议。换言之，完成这次身份的转换，短期内你不可能再有大的进步，那么接下来你需要做的就是保持低调，低调，再低调。不要在乎一时的得失，不要羡慕人家的提拔，埋头做事两三年，你的收获慢慢也会来。
第四，准备好吃苦受累 。一乡镇工作本身比学校累，休息日几乎难以保证，而在学校不可能这样，二作为新人，尽管也是副科级干部，难免还是会被其他人算计，承担更多的工作，白加黑五加二是常事，对个人身心是极大挑战。所以一旦进入乡镇工作，你首先要确保有一个好的身体，同时也要做好家庭思想工作，取得他们的理解和支持，不能因为工作忙无法顾家而后院起火，顾此失彼影响前程。
总之，从学校到乡镇是一个大转换，从职业角度考虑也是一种挑战，对于不甘平庸想做点事的人来说，这是一个好的机会。40岁，人生不晚，正是干事创业的年龄，想清楚了，大胆去做错不了。
听我一句劝。工资会降很多，千万不能去。
我是从中学一级转到副科公务员，工资勉强持平，但与之而来的责任和压力比之前翻数倍有余。每天就是在各种会议和扯皮中度过，人生已经没有乐趣了。
副高职称事业编相当于副处的待遇，看这副高的职称，得到的人年龄应该也近40了，40去干副科级有点亏，除非你的资源非常好，你的实力非常强，要不没啥必要。现在干部年轻化太强烈，35是一大关，30是副科都不算年轻。