两人战斗时间不同，同时两人的意志不同，虽然都是为了保护木叶但是从整体来说猿飞日斩会更强一些，毕竟他对抗的是一代和二代虽然不是完全体，但是也很强，佐助和团藏，佐助不能达到一代和二代的实力
很高兴能回答题主提出的问题，同时能有机会在这里和各位同样喜欢火影的小伙伴进行讨论！如果让我选的话，我更倾向于团藏，为什么呢？原因有以下几个方面。
首先，团藏和三代早期同为二代的精英护卫队，那说明两人的实力在那个时候应该是不分伯仲的，但后期的团藏还拥有数十只可以开启伊邪那岐的写轮眼，那就意味着是数十个团藏轮翻与三代一个人进行车轮战，结果肯定是不言而喻的了！
再次，团藏后期还拥有了止水的写轮眼，可以发动号称最强幻术的“别天神”，实力上就更上一层楼！
然后，三代虽然有猿魔这样强力的通灵兽，但是团藏也有传说级别的“梦貘”，在这里两边都可圈可点，就算打平了吧！
最后，团藏可是植入了初代火影柱间的细胞，然后掌握着稀有风属性查克拉，三代应该不能与其进行抗衡！
所以综上所述，我认为团藏要更强一些的，但是在剧中却被佐助吊起来打，也只能说明“关系户”的实力太强大了，毕竟人家佐助是高人气主角，轻松被团藏弄去领盒饭，火影因此失去的那些粉丝，团藏一个人圈得回来吗？
以上就是我个人的一些愚见，有不妥之处还请大家批评指正！
感谢邀请，欢迎大家点赞关注大魔王。
团藏和三代火影是同一个时代的忍者，他们两个一个是木叶的光一个是木叶的根对于木叶都是有着很突出的作用的，但是从实力上面来说的话三代应该是要比团藏差了一些的。 
从一开始二代选择猿飞日斩当火影的时候团藏就是十分的不服气的，他认为自己一点也不比三代差。他们两个也是一起战斗过的伙伴所以彼此应该还是比较了解的，那么团藏的实力的确应该要比三代强一些。
再看他们两个人的对手，三代的对手是大蛇丸。全盛时期的大蛇丸实力的确是很不错的但是团藏的对手则是已经初步开启了须佐的佐助，大蛇丸全盛时期也没有这个时候的佐助要强。
而且团藏还留了写轮眼这个能力，那么多的写轮眼等于是给了团藏好几条命。本来两个人的实力就是差不多的，而要是团藏多了好几条命的话那三代肯定不是团藏的对手了。
最关键的就是看封印术尸鬼封尽了，要是伊邪那岐可以免疫尸鬼封尽的话那肯定是团藏赢要是免疫不了的话那就是两个人同归于尽了。所以团藏还有赢面，但是三代最好的结果也就是同归于尽了。
志村团藏、猿飞日斩。这两个人其实在剧情中刻画的并不是那么详细。团藏成为男二主角佐助成长道路上的剧情杀，猿飞日斩多多少少也是属于剧情杀的情况。在剧情的基础设定上，猿飞日斩这个三代火影的实力绝非只有动画中表现出来的那么点。但是，在后期"神仙大战"以后，前期的剧情就开始各种被"打脸"。许多基础设定就崩盘了。
死于剧情杀的志村团藏
为什么说是剧情杀？
别天神、若干数量的写轮眼、柱间细胞。团藏一个年过半百的老年人，而且还是在设定上没有任何优秀血统的传承之下，驾驭宇智波家族与千手家族两大力量（按理说这可是六道仙人直系传承的两种仙人之力）。团藏以一个普通人的身份驾驭这两种力量，从侧面来看，团藏本身的实力还是很高的。虽然在写轮眼的运用上，柱间细胞提供了查克拉，但是柱间细胞自带的能力也是很强的，没有像大和这种万里挑一的实验体想要使用柱间细胞，无论是难度还是风险，基本上都是拿命来论证。当然，团藏能够使用这两股能力，多多少少也有很大程度上是大蛇丸的科学研究的功劳。但是，与卡卡西对比来看，卡卡西只是移植了一种血统能力就让他日常性的"蓝不够"。团藏直接移植两种血统之力，没有优秀的身体素质的话，基本上，能成功移植就已经很不错了，能不能用就是后话了。且团藏年轻时候也是二代身边的直属忍者，其实大家可以仔细观察一下火影，基本上在影级人物身边的忍者，不是有其他的特殊的能力(比如优秀的感知能力)，就是下一代的影级忍者候选人。团藏虽然没有当上火影，并不是实力问题，而是品格问题没有猿飞好，所以没当上。
打败团藏的不是佐助，而是面具男
只能说佐助在当时也是给领导面具男打工的。大家可以去看看那段剧情，团藏自身就说过要保留一部分查克拉来对付宇智波斑(面具男)。没有香菱这个感知忍者的辅助，没有面具男的压场，佐助想要打赢真的难。当局者迷旁观者清，香菱虽然没有直接参加战斗，但在一直在帮助佐助分析，如果从公平上来将，团藏的两个手下没有被面具男用神威吸收的话，像香菱一样在旁边观察战斗为团藏提供线索的话，佐助基本完败。要知道，团藏的两个手下其实并非垃圾，在回忆剧情中，这两个人的实力就是精英上忍级别的，但是被面具男杀了。然而，那个时候的设定是，面具男是宇智波斑不是宇智波带土，如果面具男是以斑的身份在战斗的话，解决两个上忍肯定是mei问题的，不然宇智波斑这层身份就没有任何意义了。这样一分析下来，团藏被剧情杀的可能性就是百分百的。
猿飞日斩尴尬于剧情设定
想必在火影忍者中，三代火影是最无奈的。明明说好的我最强，却偏偏被打得学猫叫。因为当时的三代，和同时期的土影大野木比较起来，真的尴尬。所以，后期忍者大战基本上就是血统大战。没有过硬的血继限界以上的能力，想要上个战场还真的很难。所以，猿飞日斩到底有多强，我们也不要说，毕竟没有猿飞日斩年轻的时候任何回忆剧情。从火影开篇时，三代火影就是个老头，快要入土的老头。反正剧情设定他最强，他就是最强。
如果志村团藏和猿飞日斩单挑的话，也不好说，一个是剧情设定的最强；一个是拥有宇智波和千手两家血统之力的，以及还有伊邪纳岐和最强幻术别天神的忍者。且别天神也是众多火迷吹嘘的最强的招式，基本上是无解的，瞪你一眼你就是我的人的这种幻术，不知道三代有没有应对之策。 
感谢邀请！
前期的三代和后期的团藏，分析下他们两人实力的话，可以从他们生命中最后一战来分析，因为那代表了他们真正的实力，面对死亡毫无保留。
下面我来分析下，他们最后一战所表现出来的实力。
猿飞日斩
最后一战是在和大蛇丸的战斗中，由于使用了尸鬼封尽，封印了大蛇丸的双手，自己也牺牲了。这一战，基本的忍术就不说了，因为在影级别战斗中，这种级别的忍术根本杀不死人。
这一战中，三代火影使用多种查克拉性质的忍术，三代火影能够使用五种性质查克拉忍术。通灵兽猿魔，可以说在火影里面算是数的上名的通灵兽，有思想会忍术，非常强大。封印术尸鬼封尽，算得上三代比较强的忍术了，不过代价有点大。三代火影被称为忍者博士，所会的忍术可能并不是这一战中所表现出来的这些，但是有时候实力强大，并不是以会的忍术多少来判定，有突出的忍术才能代表实力。
志村团藏
后期的团藏，可以说有点变态了，当然这个变态并不是实力的表态，而是心理的扭曲，我觉得他是火影里面唯一一个洗不白的角色
言归正传，我们分一下，后期他与佐助一战所表现出来的实力。团藏是一个风系性质查克拉的忍者，拥有强大风系攻击忍术，攻击犀利。宇智波灭族事件以后，团藏收藏了，大量写轮眼，把他们放置与右臂，用柱间细胞控制。控制了这么多写轮眼，能够施展禁术伊邪那支，把对自己不利的变成虚幻，把对自己有利的变成现实，代价是这个眼睛永久失明。团藏眼睛移植了止水眼睛，能够使用最强幻术别天神。团藏最后死的时候，还会使用封印术，四象封印，把周围敌人封印在自己身体里面的忍术。
综上所述，他们两个属于同一时代忍者，都师从二代火影千手扉间，但是猿飞日斩被推荐为火影，个人觉得二代之所以推荐猿飞日斩并不单单因为猿飞日斩觉悟高，实力这时候应该也在团藏之上。但是后期的团藏，掠夺了大量写轮眼，并移植了止水眼镜，还有柱间细胞，实力应该在三代火影之上了，因为他有很多条命，可以在现实与虚幻中穿梭，也就是他有很多条命，前期三代火影如果和他对战的话胜率应该比较渺茫。
此文仅代表个人观点，欢迎指正。