马英九访陆的“特别会面”于10日下午16时在北京人民大会堂“东大厅”正式登场。
马英九致辞表示，“这次他带台湾青年学子访陆，感谢大陆方面热情接待，同学们深刻了解中华文化，体验两岸血浓于水的情怀，中华民族经历了两岸一步一步共同迈向中华振兴之路，虽然两岸在不同体制下发展，但两岸人民都是炎黄子孙，应该致力于振兴中华。”
“对台湾来说，没有稳定和平的两岸就没有安定幸福的台湾，对中华民族来说，如果没有和平繁荣的两岸，就没有璀璨光明的未来。最近两岸情势紧张，引发不少台湾民众不安，他也引述鲁迅所说，两岸应该渡尽劫波兄弟在，相逢一笑泯恩仇。诚挚期盼两岸互利共荣、携手合作振兴中华，让中华民族在全世界面前抬头挺胸。”
对马英九访陆的“特别会面”，台陆委会10日晚紧急发表声明称，马英九此次与大陆会晤时重提九二共识，未能向大陆公开传达台湾人民对“捍卫主权及民主自由体制的坚持”，有违台湾社会的期待，“我们深感遗憾”。当前对岸持续“施压”，企图迫使台方接受“一中”框架，是造成台海情势不稳定的根源。
而民众党则是直接反驳陆委会的说法，认为马英九于致词时强调两岸民众对于“和平、繁荣”的深刻冀望，这的确符合台湾人民期待。马英九以个人身份展开交流，为和平努力，仍有其值得肯定之处。而陆委会仍是“以对抗为主轴”，只顾自己政党利益，不顾台湾人民的安危。
对此，国民党团发出新闻稿表示，“双方在致词时以‘先生’互称，马英九更提及‘九二共识’为1992年各自表述一中各表的论述，充分展现两岸对等、相互尊重的立场；并强调坚守‘反对台独’的基本主张。双方再次对话，不但开启两岸的和平交流新的契机，让台湾多数民众希望两岸和平交流、共存共荣的声音，被对岸领导人及大陆同胞听到。”
“两岸民众仍需在和平稳定的基础上互动交流，才能让冲突的可能性降到最低。国民党团重申，反对台独、不支持台独是国际共识，更是世界美、日等国家的具体主张。国民党团坚持“亲美和陆”的基本立场，在此基础上加强与国际社会及两岸稳健、务实交流，共创双赢。”
针对马英九此次大陆之行，台湾学者分析指出，在两岸交恶、民进党无法处理对陆关系之下，马英九推动两岸和平的角色就特别突出，并扮演两岸的“和平使者”角色。马英九是想要透过行动，在一定程度上影响大陆，缓和两岸紧张，让大陆在思考对台动武时有所迟疑。未来两岸关系不好时他可能就会访陆，也彰显自身的重要性。
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