可能是因为受国力所限
哈萨克汗国并非在准噶尔的统治之下，清朝在灭掉准噶尔之后，立即就引起了哈萨克汗国的警觉，而眼瞅着中亚诸国已经有抱团之势，清廷决定结束战争，保住自己刚刚占领的地区
提及哈萨克汗国的历史，就不能不提准噶尔，它俩是一辈子的仇敌。
准噶尔原本是厄鲁特蒙古的一个部落，厄鲁特是清代对漠西蒙古的称呼，明朝时候管他们叫瓦剌，而他们自称是卫拉特。
厄鲁特蒙古，也就是漠西蒙古，他们与东部蒙古在血缘上并不是那么紧密，虽然大家都是蒙古人，但东蒙古一直是看不起西蒙古的。
蒙古民族是由成吉思汗开创的，“蒙古”的名字就是来源于东蒙古地区斡难河上游的蒙古部，后来成吉思汗统一了整个蒙古高原，将整个高原上的各个部落整合为蒙古族。而位于西蒙古地区的这些蒙古人，其文化和血缘与东蒙古地区相差较大，以至于东蒙古压根不把西蒙古当做是蒙古人。在1640年编写的《喀尔喀—卫拉特法典》中明确表示，卫拉特蒙古（西蒙古）不算是蒙古。
1388年北元后主脱古斯帖木儿被阿里不哥后裔也速迭尔杀害后，大元国号停止使用，蒙古也很快分裂成为东部的鞑靼（东部蒙古，也叫中央蒙古，由黄金家族担任大汗）和西部的瓦剌（西部蒙古），双方之间互相打仗。
到了明末，东西蒙古都处于分裂状态，后金（清朝）兴起之后，利用东蒙古各部之间的矛盾，远交近攻，吞并了东蒙古南部地区，灭掉了蒙古大汗直接统辖的察哈尔部，建立了漠南蒙古，开启了吞并蒙古的征途。
察哈尔部的灭亡震惊了整个蒙古高原，东部蒙古地区只剩下了漠北蒙古。而面对强大的清朝，漠北蒙古选择向清朝称臣，而为了牵制漠北蒙古，漠西蒙古（西蒙古）的盟主，和硕特部首领固始汗也派人前往盛京，向清朝称臣。
在明末清初时漠西蒙古分成五大部落：和硕特部、准噶尔部、杜尔伯特部、土尔扈特部、辉特部。后来由于土尔扈特部西迁，于是只剩下了四个。在清初时，和硕特部是漠西蒙古的老大。
1676年，准噶尔部台吉噶尔丹打败和硕特部盟主鄂齐尔图汗，把松散的部落联盟逐渐转变为强有力的中央集权制汗国，建立了准噶尔汗国，噶尔丹自称大汗。
准噶尔汗国崛起之后就开始四处扩张，噶尔丹先是灭掉了位于新疆的叶尔羌汗国，将天山南北尽收入囊中，然后又向西与哈萨克汗国开战。
其实早在准噶尔统一漠西蒙古之前，准噶尔部就常年与哈萨克部交战。哈萨克汗国建立于1456年，是成吉思汗后裔贾尼别克汗（术赤系）所创立的了。
在准噶尔尚未统一漠西蒙古之前，准噶尔和哈萨克的交战各有胜负，而在噶尔丹建立准噶尔汗国之后，哈萨克就只有挨揍的分了，噶尔丹将哈萨克人打得吐血。
不过哈萨克并非噶尔丹的第一目标，噶尔丹的愿望是统一整个蒙古高原，之后南下北京，重现当年蒙古帝国盛世。1688年，噶尔丹率兵越过杭爱山进攻漠北蒙古（东蒙古），这一举动成功地保住了哈萨克汗国。
上文解释道，在清初的那个时代，漠北蒙古根本不把漠西蒙古看做是同胞，对于噶尔丹的来袭，漠北蒙古就视之为异族入侵。由于不敌噶尔丹，后经活佛哲布尊丹巴呼图克图倡议，漠西蒙古全部投降清朝，清军清军保护，康熙皇帝决定北上抵御噶尔丹。
（噶尔丹时期的准噶尔汗国，当时准噶尔的主要目标是与清帝国作战，无暇顾及西面的哈萨克）
正当噶尔丹欲倾兵南下时，他的侄子策妄阿拉布坦发动政变，端了噶尔丹老巢，导致噶尔丹失去后援。但此时的噶尔丹没有选择回国与策妄阿拉布坦争权，而是选择孤注一掷，南下进攻中原。
1690年，噶尔丹引兵三万在乌珠穆沁击败清军先锋部队，随后直接杀到了内蒙地区，清廷大惊，康熙皇帝宣布北京戒严，并立即调集八旗和内蒙蒙古骑兵共10万前往迎战，双方在内蒙古乌兰布通展开大战。
此战康熙原本是御驾亲征，但在到达乌兰布通之前，在大臣的“劝说”下，最后还是抱病留守，由和硕裕亲王裕亲王领兵前往。
刨去辎重部队，清兵投入到前线的兵力大约在8万人左右，在兵力上对准噶尔有绝对优势，并且清军的大炮和火枪数量都远多与准军，因此清军在战术上多多路进军，意图全歼准军。
但是在之前的乌珠穆沁之战中已经暴露出清军战斗力不低准军，双方大肉搏战清军不占优势。而面对清军的来袭，准军祭出了“驼城”部署，这一战术应该是脱胎于欧洲的“胡斯车堡”，在15世纪是一种非常有效地阵地战术。
由于在准军的驼城正面是沼泽，清军大炮的射程够不到，于是福全决定迂回攻击，但却被准军反杀，以至于一等公佟国纲都战死了。
无奈之下，福全只得依靠兵力优势与准军开炮对射，最后由于弹药告罄，准军以议和为由骗过了福全，从容撤退。
准军北撤之后曾向清廷求和，毕竟老家都没了，噶尔丹一时很难重建根据地，无法获得大量兵力补给。但噶尔丹并没有投降之意，而清廷也加紧对漠北蒙古的控制，双方都在准备着新一轮战事。
1696年，清军在昭莫多（乌兰巴托南部）与准军再战，清军以绝对优势兵力重创准军，噶尔丹败逃自杀，其骨灰被他侄子策妄阿拉布坦获得，最后在清朝的威逼下，策妄阿拉布坦将噶尔丹骨灰交给了清朝。
噶尔丹死后，策妄阿拉布坦统领准噶尔汗国，这个人非常厉害，在他的统治下准噶尔进入全盛时期，准军在外蒙多次击败清军，1731年清军于博克托岭、和通泊之战惨败给准噶尔，迫使清廷与准噶尔言和。 
（雍正时期的准噶尔汗国）
在于清廷言和之后，准噶尔汗国逐渐腾出手来对付北边的沙俄和西边的哈萨克。
由于在头克汗之后，哈萨克汗国分裂成了大、中、小三个玉兹，实力有所衰弱。而面对着强大的准噶尔，哈萨克汗国又是被欺负地抬不起头来，特别是与准噶尔接壤的大玉兹，更是直接能臣服于准噶尔。
但好在沙俄不愿意看到准噶尔称霸中亚，总是在背后支持哈萨克，让哈萨克汗国免于亡国。
（准噶尔汗国，大玉兹在后期被准噶尔给兼并了）
1745年，准噶尔第三代大汗噶尔丹策零（策妄阿拉布坦长子）染瘟疫暴毙，准噶尔陷入严重的内斗，哈萨克汗国中的中玉兹大汗阿布赉趁机东进，收复了许多失地。
但令哈萨克人万万想不到的是，在捕获准噶尔内乱的消息后，当时在位的乾隆皇帝顶着所有所有人的压力，直接发兵五万攻打准噶尔。
1755年，清军在辉特部台吉阿睦尔撒纳的引导下一举灭掉了准噶尔汗国！此消息立即震惊了整个哈萨克汗国，哈萨克大汗阿布赉迅速在中哈边境部署兵力，严阵以待，堤防清军来袭。此外哈萨克还大量收留从准噶尔逃民，并积极与沙俄联系，共同抗击清帝国。
在拿下准噶尔之后，清军在中哈边境与哈萨克发生多次小规模冲突，双方均有胜负。由于南当时南疆地区又发生了大小和卓叛乱，清军主力尽数南调，无力在向西与哈萨克开战。在觉察到中亚的几个汗国已经抱团的情况下，清挺决定熄战，保住新战略的土地，于是最后中哈双方达成议和，划分边界，而哈萨克汗国则向清朝称臣。
公元17世纪开始的亚洲，实质上是清朝和俄罗斯对蒙古人的联合绞杀，清朝从东北出发，而俄罗斯从西北开始，两大帝国相遇之地便是准噶尔汗国和哈萨克汗国。
哈萨克汗国的建立者，成吉思汗长子术赤的后裔克烈汗与贾尼别克汗。
准噶尔汗国的建立者，是漠西蒙古，也就是卫拉特蒙古，明朝称其为瓦剌。
1、哈萨克汗国并非准噶尔汗国的属国，事实上两国曾在中亚地区大战两百年。
战争以公元1525年卫拉特蒙古对外扩张开始，并于公元1757年清朝和哈萨克汗国对准噶尔汗国的两河绞杀而结束，卫拉特蒙古在公元1676年由噶尔丹正式建立准噶尔汗国。
两国的战争可以分为四个阶段：
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1525年~1569年，哈萨克汗国与卫拉特汗国之间的拉锯战
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1570年~1635年，哈萨克汗国击败卫拉特汗国，卫拉特蒙古土崩瓦解
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1644年~1727年，噶尔丹建立准噶尔汗国后击败哈萨克汗国，哈萨克汗国分裂成了大、中、小三个玉兹，与准噶尔接壤的大玉兹则直接能臣服于准噶尔。
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1728年~1757年，哈萨克汗国在清朝出兵准噶尔汗国的同时出兵，与清朝联手灭了准噶尔汗国。
所以，哈萨克汗国与准噶尔汗国一直是敌对的关系，两百年来，哈萨克汗国曾击败准噶尔，准噶尔也曾击败哈萨克。 
在哈萨克和准噶尔之间，取得胜利的是哈萨克，但哈萨克也没有笑到最后，因为俄罗斯人来了。
2、清朝和俄罗斯从东西两个方向征服蒙古人 
俄罗斯的崛起，源于反抗蒙古人金帐汗国的统治。
公元1480年，蒙古人统治了俄罗斯人240年之后，俄罗斯终于独立，并击败蒙古人，越过乌拉尔山，开始了向东方的征服运动。
明朝末年，后金崛起于我国东北，并于公元1635年击败了漠南蒙古最后一任大汗林丹汗，从此清朝皇帝兼任蒙古大汗 。
从公元1635年到公元1757年，清朝用了122年的时间，最终征服了蒙古三部——漠南、漠北、漠西。这蒙古三部其实便是当年的元朝和窝阔台汗国、察合台汗国。
而漠西蒙古在清朝之时称为准噶尔汗国。
因此，当年的蒙古帝国，位于波斯的伊尔汗国最终融入了波斯，而剩下的部分则被清朝和俄罗斯瓜分。俄罗斯征服的蒙古部分是当年的金帐汗国分裂之后的一众汗国：西伯利亚汗国、喀山汗国、克里木汗国、阿斯特拉罕汗国、哈萨克汗国等等。
那么，清朝为何不继续征服哈萨克汗国？主要原因便是俄罗斯人来了。 
清朝在灭了准噶尔汗国之后曾与哈萨克汗国打过两次仗，互有胜负，公元1757年6月7日，哈萨克汗国与清朝签订了《阿亚古兹停战协议》，双方正式停战。
之后，哈萨克汗国开始了漫长的反抗沙俄入侵的战争，至公元1847年，哈萨克汗国末代可汗克涅赛热汗在反抗沙俄的战争中被杀，哈萨克汗国亡，俄罗斯占领了哈萨克全境和整个中亚地区。
清朝征服了准噶尔汗国，俄罗斯吞并了哈萨克汗国，这便是结局。
在清朝的不少皇帝中，都有向着新疆地区用兵的经历，比如康熙就为了维护大局，有着向攻打蒙古各部落进而吞并哈萨克汗国的噶尔丹，后世也有左宗棠为了维护新疆处于中国领土完整性反击沙皇扶立的阿古柏的军事行动，但是在历次清朝对新疆的军事行动之中，虽然模仿前几个朝代的设立都护府的方式在新疆设立了伊犁将军，但是清朝没能统一准格尔治下的哈萨克汗国，这是为什么呢？
1：哈萨克的历史
其一：强盛的帝国
在哈萨克全盛的时期，他也是一个及其庞大的帝国。 在哈斯木即位的时候，在他的带领下，哈萨克的国力和领土扩张的很快，在草原上，他建立起一个人口多大百万，兵力几十万的帝国，广袤的草原成为了他的后花园 ，并且打败了他最大的竞争对手察合台汗国。但是在他去世之后，这个庞大帝国迅速走向了衰弱，并且受到了东蒙古的压迫之后，准格尔和哈萨克的冲突长达数百年，在很长的一段时间之中，准格尔一直强势压制着哈萨克帝国。
第二：中兴之后和满清冲突
在哈萨克帝国就这么沉寂一段时间之后，直到他们迎来了阿布莱汗。在他的统治和带领之下，帝国又重现往日的辉煌，他率领他的部属反击收回了自己的故土。在 和俄国的沙皇签订了互不侵犯的条约之后，阿布莱汗带领军队击败了长期压制自己的准格尔。在满清灭亡了准格尔之后，双方也进入了冲突的时期，但是为什么双方很快就停止战争 ，划定了边疆，那么，清军为什么没有乘胜成功一举统一哈萨克汗国呢？
2：清军的蠢蠢欲动
其一：清军等来了机会
在和准格尔进行你死我活的过程中，因为蒙古和哈萨克军队长期处在战争的位置，这两的损耗都是非常大的地步。这时候清军就开始下山来摘桃子 ，于是在大敌当前的局面之下这两不得不联合起来抵御清军的进攻。清军趁着这个机会，集结了大批军队，并且命令臣服自己的部分蒙古军队配合自己进攻 。正当清军信心满满准备把他们一锅端的时候，很快，清军就因为四十万大军自信满满遭到了哈萨克铁拳的毒打。
其二：清军的惨败
正当清军大肆开进蒙古草原的时候，惊奇的发现，哈萨克的军队战斗力超出了他们的想象。本以为他们是下山摘桃子的清军在草原上不出意外的碰到了磨刀霍霍的十几万哈萨克部落的骑兵，在一顿交火之后， 清军大败，看似雄师的几十万军队在哈萨克骑兵的切割下马上死伤了大部分兵马，另外，正当这两在大草原上打的兴高采烈的时候，清军发现在他们的周围，除了眼前的庞然大物，还有不少或明或暗的势力准备在这两两败俱伤的时候捡桃子 ，于是，清军就和哈萨克部落议和了。
主要有三个方面原因：
一是大清力量有限。清王朝与准格尔连年征战，财力、人力已经消耗很大，击败准格尔已经非常不容易，要想再占领哈萨克汗国非常困难。
二是哈萨克汗国离中原太远，战略价值不够。哈萨克汗国一片沙漠，清朝对它没有任何战略兴趣，也不愿用钱用人用力去征服。
三是清朝统治者已没有攻城掠地的野心和动力。清朝统治者已经满足于坐守资源丰沛的中原之地，和鱼米之乡的江南，沉迷于天朝上国的美梦，已失去开疆扩土的血性。