尽管核计划受阻，但是日本并不是很担心。原来，日本在自己进行核计划的同时也紧密跟踪着其他发达国家的核计划进展，特别是美国和德国。日本曾经组织包括仁科芳雄和荒胜文策在内的多名物理学家组成“核物理成就利用委员会”对发展原子弹进行整体研究。该委员会估计制造一颗原子弹需要至少一吨铀235，这需要从几百吨铀矿石中提取，而分离出铀235的工程大约要消耗日本全年发电量的1/10和日本全国铜产量的1/2。基于这种估计，该委员会认为美国和德国也都没有多余的工业能力可以及时生产出原子弹用于战争。
1945年4月，仁科芳雄在东京的实验室在美军轰炸中被毁，“仁计划”被迫中止。而此前荒胜文策领导的“F计划”也因为分离铀材料的加速器始终不合格而告终。
1945年8月6日，广岛在核弹“小男孩”降临后成为一片废墟。仁科芳雄马上带人进行实地检测，随后向军方确认正是基于铀235的原子弹所为。此时，根据己方对生产铀235所需成本的计算，日方误判美国只有一颗原子弹。因此，疯狂的日本军方召集这些科学家们做最后的赌博：“一旦美军登陆，日本军队和民兵将不惜任何代价坚持6个月。如果你们能在这个期间研制出原子弹，我们就可以把美军赶下大海。”但仁科芳雄哀叹：“不要说6个月，就是6年也不够。我们既无铀，又没电，什么也干不成。”至此，历史无情地宣告了“仁方案”的彻底破产。
1945年8月9日，又一颗原子弹在长崎爆炸，日本意识到自己已经没有时间与盟军慢慢讨价还价了。仁科芳雄等人也到长崎进行了检测，结果发现这是一颗基于钚的原子弹，而这种技术日本并没有想到。