其次，建设东海岸铁路将征用357公顷森林保留地，这些森林保留地为多种野生动物的栖息地。众多自然生态组织协会因担心此举会破坏生态环境，联合调动群众抗议，要求政府暂停计划。再者，东海岸铁路工程备受全球关注，美国和日本都很想撬走这笔生意。拼实力不行，就玩手段。内外夹击下，马来西亚便单方撕毁了与中国签订的合约。
当时，该工程已进行1年之久，期间大量器械运作、人力物力和相关产业的运转，都因此而搁浅，每日耗损数字惊人。按合同相关违约责任条款计算，马来西亚需要赔偿我们361亿元违约金。
马哈蒂尔一听着了急，他们哪有这么多钱啊，于是立即启程前往中国。抱着有困难咱就解决困难的想法，历经马中两国政府以及相关公司多个月的谈判后，事情再度发生转机。MRL公司跟中国交建签署附加协议，第一和第二阶段的建筑成本削减到440亿令吉，东铁计划实现复工。
根据补充协议，东铁全长更定为640公里，计划2026年底前完工，中马各持50%股份。调整后的线路方案将更加有利于促进当地经济增长，在环境保护及社会影响等方面带来更大效益。
常言道好事成双，马来西亚新一届总理上任后，不仅恢复了东海岸铁路此前削减的里程，还和我国签订了合作三方谅解备忘录，再次加深双方合作。如今，马来西亚媒体也频频为中国发声：认为西方在看待中国问题时太过“双标”。