2009年开始，飞鹤以承担黑龙江省重大研究项目和国家“863计划”为契机，开始系统性地进行母乳基础研究。十余年间，飞鹤已建成有近20000个样本，覆盖国内27个省（区、市）的母乳数据库。
围绕母乳，飞鹤的研究触角逐渐深入。
乳铁蛋白是母乳中重要的免疫物质之一，是宝宝成长不可或缺的免疫蛋白，有助于改善婴幼儿营养状况，降低各种婴幼儿疾病的发病风险。
母乳和牛乳在蛋白氨基酸序列上具有69%的同源性，二者具有相似的活性。但牛乳蛋白中的乳铁蛋白含量平均只有0.06g/L左右，仅是母乳的十分之一。
由于婴儿配方奶粉的原料主要是牛乳，如果要让宝宝吃到乳铁蛋白接近母乳的奶粉，唯一的办法是把更多乳铁蛋白添加进去。
然而，此前中国乳铁蛋白主要依赖进口。2018年10月，国际乳铁蛋白供应短缺，一度导致国内乳铁蛋白价格由每公斤3000元飙涨至3万元，甚至有价无市，影响国内配方奶粉生产。
2017年7月，中国实施食品安全国家新标准《食品营养强化剂乳铁蛋白》GB1903.17—2016，对乳铁蛋白的理化指标进行了修改，将乳铁蛋白纯度要求提升至95%。但在当时，国外供应商能达到的纯度在80%左右，能符合95%标准的是极少数。
怎么办？与其受制于人，不如自力更生，飞鹤决定攻克这一难题。
据飞鹤应用技术部副总监解庆刚介绍，首当其冲，摆在飞鹤研发人员面前的两个问题便是“如何从牛奶中提取95%纯度的乳铁蛋白？”以及“乳铁蛋白是热敏物质，在加工过程中，如何通过温度控制，以确保乳铁蛋白的活性？”
提取乳铁蛋白可以使用超滤膜分离法，成本低，装置简单，操作容易，但提取出来的乳铁蛋白纯度只有60%左右，远不能达到国家95%纯度的要求。另一条技术路线是离子交换层析法，在制药领域应用比较成熟，提取乳铁蛋白纯度能超过90%。唯一的“缺点”就是贵！为了高纯度、高活性的乳铁蛋白，飞鹤决心锁定“层析法”：利用牛奶中乳铁蛋白和其它成分物理性质不同，运用离子交换树脂吸附牛奶中的乳铁蛋白，进一步洗脱纯化。
最终经过上千次的反复试验，用了足足三年多时间，飞鹤终于在2022年建起一个各项参数都相对完美的乳铁蛋白生产线，成为这场长跑中的又一高光时刻。