轰-6丙轰炸机加装研发第二代的整合导航/投弹瞄准系统，该系统由LHS-2轰炸计算机、HL-3航空信息导航仪，BDP-1航姿航向参考系统(AHRS)、DPL-1(773型)多普勒导航雷达组成，同时还加装了KJ-3C自动驾驶仪、HZX-1陀螺仪、WL-7自动定向仪(ADF)和修正后的HL-2A(244型)投弹瞄准雷达。该机还配有WD-3敌我识别询答器、WJ-2A雷达预警接收器(RWR)、HM-3光学投弹瞄准器和211型武器测距雷达。许多元件都是基于西方国家的设计，这套新系统最初是由一架轰-6甲于1975至1981年间进行测试，后来定型轰-6丙，
它不仅可以运载传统炸弹和核弹，甚至还可以投送反舰水雷和鱼雷，配备了新式低阻力弯曲翼尖、其翼展并从32.989米略为增加到34.19米、机翼面积则从164.65平方米增加到167.55平方米，新的翼尖整流罩使飞机的最大航程增加了350公里，其机翼前缘除冰器的出气口改到整流罩的下侧而不是横向。1982年，轰-6丙从第12批开始量产，逐渐取代了原本的轰-6甲，到1990年前，绝大多数的轰-6都是属于轰-6丙，并同时服役于空军和海军航空兵部队，这个时期的轰-6轰炸机基本属于二战水平，只能临空投放铁炸弹，面对美苏的大量的防空导弹，可以说和越南战争中大量被击落B-52轰炸机一样处于完全无用的阶段，
二：从80-00年代的轰-6轰炸机
1975年，以轰-6甲为基础，开始专为海军航空兵开发可以执行远距攻船任务的衍生型。该型新机最初称为轰-6IV，后来也被重新命名为轰-6顶」，其主要武装改为两枚鹰击-6L导弹，鹰击-6L(出口型号C-601，北约代号CAS-1巨妖)是以海鹰舰载/岸基反舰导弹为基础研发而成，由于是全新概念的武器系统，直到1981年8月29日原型机才完成首飞，再过整整两年系统整合以及实弹试射等测试工作才均告完成。由于轰-6丁也维持了水平轰炸的能力，所以为此还改装了HM-3A光学投弹瞄准器。